Bioinformatiker

Bioinformatiker

Stockholm

Ref.nr SU FV-0929-23

Vid Institutionen för biokemi och biofysik. Sista ansökningsdag: 2023-03-19.

SciLifeLab grundades 2010 som en gemensam satsning mellan fyra universitet: Karolinska Institutet (KI), Kungliga Tekniska Högskolan (KTH), Stockholms universitet (SU) och Uppsala universitet (UU). SciLifeLab utgör en unik miljö och är idag ett internationellt ledande forskningscentrum. Forskare och ingenjörer vid SciLifeLab utvecklar, använder och erbjuder avancerade tekniker för att skapa ökad förståelse av livsviktiga processer på molekylär nivå med fokus på hälsa och miljö. SciLifeLabs nationella infrastruktur stöder forskningsverksamhet vid alla svenska universitet samt inom hälso- och sjukvård och industri. Bioinformatik och systembiologi är viktiga aktiviteter inom SciLifeLab, och en betydande del av SciLifeLabs personal arbetar inom dessa områden. National Genomics Infrastructure, NGI, är den största tekniska plattformen vid SciLifeLab. Det är en nationell resurs som erbjuder en infrastruktur för state-of-the-art DNA-sekvensering och SNP-genotypning till forskare i Sverige. Målsättning är att ge tillgång till de senaste metoderna inom storskalig DNA- och RNA-sekvensering och ge riktlinjer och stöd för provtagning, studiedesign, protokollval och bioinformatikanalys för att möjliggöra världsledande forskning.

Arbetsuppgifter

Vi letar efter en bioinformatiker för att gå med i vårt utvecklingsteam vid NGI, en av Europas största sekvenseringsanläggningar, på SciLifeLab i Solna. Den utvalda kandidaten får en varierad roll och kommer att vara delaktig i många typer av uppgifter. Arbetsuppgifterna inkluderar bland annat att:

• Arbeta i samarbetsprojekt med användare.
• Analysera data från interna utvecklingsprojekt.
• Utveckla nya analysflöden.
• Programvaruutveckling, till exempel för kvalitetskontroll.
• Automation av data / analysflöde.
• Hjälp för att hålla befintliga pipelines och verktyg ”state-of-the-art”.

Kvalifikationer

Krav

• Programmeringskunskaper, främst i Python, alt. R, Perl, Java eller C / C ++.
• Grundläggande kunskap inom versionskontroll, t.ex. git.
• Erfarenhet av att använda Linux / UNIX.
• Utmärkta kommunikations- och samarbetsförmåga.
• Erfarenhet av att jobba i ett ISO-ackrediterat facilitet för Genomik.
• Erfarenhet av informationssystem för laboratorier (LIMS).
• Du talar och skriver engelska obehindrat.

Meriterande

• Erfarenhet av att hantera stora datamängder, särskilt nästa generations sekvenseringsdata (NGS).
• Erfarenhet av HPC eller motsvarande datorsystem.
• Erfarenhet i bioinformatik eller motsvarande kompetens.
• Erfarenhet av webbapplikationsutveckling och / eller databasadministration (SQL eller noSQL).
• Erfarenhet i VueJs.
• Erfarenhet av analysering av HiC/Promoter capture data.
• Erfarenhet i provisionering med hjälp av Ansible.

Personliga egenskaper

För att lyckas och trivas i den här rollen så tror vi att du är en självgående problemlösare, med ett strukturerat och kvalitetsmedvetet arbetssätt. Du har god kommunikationsförmåga i både tal och skrift. Det är också viktigt med en bra samarbetsförmåga.

Vi kommer lägga stor vikt vid personliga egenskaper.

Anställningsvillkor

Anställningen avser heltid och gäller tills vidare med sex månaders provanställning. Stockholms universitet tillämpar individuell lönesättning, ange därför gärna löneanspråk. Tillträde snarast.

Stockholms universitet strävar efter att vara en arbetsplats som är fri från diskriminering och ger lika möjligheter för alla.

Kontakt

Närmare information om anställningen lämnas av, Head of Facility, NGI Applications Development Anja Mezger, anja.mezger@scilifelab.se
eller Bioinformatics Lead, NGI Applications Development Johannes Alneberg, johannes.alneberg@scilifelab.se.

Fackliga företrädare 

Ingrid Lander (Saco-S), tfn 0708-16 26 64, saco@saco.su.se, Alejandra Pizarro Carrasco (Fackförbundet ST/OFR), tfn 08-16 34 89, alejandra@st.su.se, samt seko@seko.su.se (SEKO).

Ansökan

Du söker anställningen via Stockholms universitets rekryteringssystem. Du som sökande ansvarar för att ansökan är komplett i enlighet med annonsen och att den är universitetet tillhanda senast sista ansökningsdag.

Bifoga endast personligt brev och CV. Kopior på betyg och intyg tar du med vid en eventuell intervju.

Anvisningar för sökande finns på webbsidan: att söka en anställning.

Välkommen med din ansökan!

Stockholms universitet bidrar till det hållbara demokratiska samhällets utveckling genom kunskap, upplysning och sanningssökande.

Sista ansökningsdag: 2023-03-19